Memelilerde n-hekzanın biyodönüşümü temel olarak karaciğerde gerçekleşir ve 2-hekzanol (2) oluşan temel metabolittir. Hücre dışında 3-hekzanol (3) ve 1-hekzanol (4) ayrıca izole edilmiştir. 2-hekzanol alkol dehidrogenaz tarafından 2- hekzanona (6) oksitlenebilir yada ikinci sitokrom P450 tarafından katalizlenen reaksiyonda hidroksillenerek 2,5-hekzandiole (5) dönüşür. Diol (5) ve 2- hekzanon (6) nörotoksik 2,5-hekzandionun (8) başlangıç maddesi olan 5-hidroksi-2-hekzanona (7) oksitlenebilir. Sitokrom P450 tarafından daha fazla oksitlenmesi sonucu 1,5-dihidroksi-2-hekzanon (9) yada 4,5-dihidroksi-2-hekzanon (10) oluşabilir. Her iki üründe n-hekzana maruz kalan erkeklerde n-hekzan ölçümü için medikal parametreler olarak kullanılır. Bir çok oksitlenmeden ve dekarboksilasyondan sonra 1,5-dihidroksi-2-hekzanon (9) insan idrarında 2-hekzan metaboliti olarak bulunan gama-valerolaktona (12) dönüşebilir. Tüm hidroksillenme bileşikleri glukuronitle yada sülfatla konjuge olarak idrarla atılır (metabolik planda gösterilmedi)